Ялтинский морской торговый порт специализируется на пассажирских перевозках и принимают круизные суда. Считается круизными воротами Крыма. Кроме того, порт перерабатывает каботажные грузы, в основном строительные материалы.
Феодосийский морской торговый порт может перерабатывать до 40 наименований грузов. Он осуществляет перевалку нефти, нефтепродуктов, контейнеров, металлопродукции, глины, песка, лесоматериалов, продовольствия.